氨基酸残基游离带电(宿主防御肽的作用和治疗潜力)

《宿主防御肽的作用和治疗潜力》共九章,本文连载:第六章“肽设计”

肽设计(第六章)

自然界有超过2000种抗菌肽并有50多种独特的结构,这为设计新颖的增强的抗菌肽提供了巨大的动力。迄今大多数肽开发都涉及结构辅助设计,通过对亲本分子适度数量的改变来优化某些关键特征,这些特征通常包括两亲性(分别在最终肽结构的独立部位带/极性和疏水性残基),带电数目,疏水残基柔韧性和兼容性和一些特殊的二级结构。许多设计原则,特别是α 螺旋结构类别的的原则,都是来自对高度简化富赖氨酸亮氨酸的肽的研究,这些肽包含有2-3个不同的氨基酸碱基,它们被用来代表一些结构特性:螺旋性疏水的环节,疏水整体性,抗菌活性的定向性等,这个方法已经成功地获得在活性方面优化的对特别顽固的(多耐药)细菌最好的抗菌肽分子。但是这个方法限制了被筛选的候选分子数量,由于这个原因,我们有志于发展允许抗菌肽随机突变的筛选方法。迄今,产生了许多希望的方法。最早,Blondelle 和 Houghten按照一个混合肽去卷积策略构造肽组合文库。不幸的是,这个策略有时限制于一些小肽,如筛选一个六聚物文库和鉴别一个6个氨基酸肽,对金黄色葡萄球菌有抗菌活性。第二个策略涉及重组过程,一个重组生成肽通过引进混合核苷酸在合成基因编码肽的多种位置随机突变。不幸的是这种重组生成肽的筛选过程很困难。第三个策略是现在发展的以纤维素为支撑的机器翻译合成多样性肽。

下一章:阳离子宿主防御肽的先天免疫效应(第七章)

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