靶向氨基酸分析
【菲律宾发现新冠病毒突变株 比原始病毒更具感染力】近日，菲律宾科学家发现了一种新冠肺炎病毒的突变株，比导致新冠肺炎病毒的原始变异体更具感染力。据了解，菲律宾基因组中心对新冠肺炎病毒进行了全基因组测序和靶向测序，在一小群阳性病例样本中检测出G614菌株和最初的D614基因型。该突变将614位的氨基酸从D（天冬氨酸）变为G（甘氨酸），因此该突变被命名为D614G，这意味着最初的D614现在变种为G614。该中心指出，考虑到G614的传播，必须对上述突变以及其他经常观察到的突变进行持续监测，”以便更好地了解新冠肺炎的进化轨迹，为控制、诊断和治疗策略提供信息。”
#菲律宾##菲律宾疫情#（图源：新华社）
癌基因及抑癌基因调控的主要下游靶点
在癌症靶向治疗领域，寻找抗癌药物潜在靶点一直是研究热点。
近日，加利福尼亚大学河滨分校研究小组提出一种靶向癌细胞的新方法，或能弥补现有癌症靶向药的不足，该研究结果刊登于美国《药物化学杂志》上。
目前，大多被选中的治疗靶点都是对癌症发展有促进作用的“流氓蛋白”，它们可以向癌细胞发出增殖信号，控制其侵入人体器官，加速肿瘤恶化。
大多靶向药作用位点是“流氓蛋白”上的半胱氨酸（20种天然氨基酸之一），靶向药通过与半胱氨酸之间形成紧密的肽键，使“流氓蛋白”失活，减缓其对癌症发展的促进作用。
之所以选择半胱氨酸是因为，它可以与特定有机官能团反应，形成强大且不易逆转的分子键。
但目前的问题是，半胱氨酸很少出现在癌症靶点结合部位，因此这种靶点的适用范围很有限。
为了弥补这一不足，加利福尼亚大学研究人员开始探索针对其他常出现在目标结合部位的氨基酸靶点，如赖氨酸、酪氨酸、组氨酸等。
他们用于进一步试验的目标是蛋白质-蛋白质相互作用（PPI），PPI中有很多潜在药物靶点，可要设计出针对这些靶点的有效药十分困难，因为PPI缺乏一个固定且可深度结合的位点。
“用我们的方法，可以设计出与赖氨酸、酪氨酸、组氨酸残基反应的药物，这些残基普遍存在于PPI结合界面，这将使具有选择性的PPI拮抗剂研发成为可能。”此项研究主要负责人、生命科学教授毛里齐奥·佩尔基亚说。
以往的靶向药物往往锁定半胱氨酸，因为它比蛋白质靶标中的所有其他氨基酸都更“灵敏”。
近年来，美国食品药品管理局（FDA）批准的奥希替尼、依鲁替尼、奈拉替尼、阿法替尼等肿瘤靶向药的结合位点都在各自靶点的半胱氨酸上。
此次研究扩大了半胱氨酸以外的可用目标空间。
随着医学进步，癌症靶向治疗，这种疗效更好且副作用更小的疗法得到越来越多的关注。
目前，学术研究人员、生物技术行业和制药公司在靶向治疗的基础上，进一步寻求研发“共价药物”，这种药与靶标之间可以牢固结合，不易发生逆转，或可改善部分耐药现象。
此次对PPI上靶标的探索或可成为“共价药物”研发的重要基石。
研究人员表示，PPI靶点不仅可用于肿瘤治疗，在包括神经退行性疾病和炎症性疾病在内的其他疾病治疗中，也将发挥巨大作用。
新突破，这些氨基酸或将拓宽癌细胞靶点范围！,癌基因及抑癌基因调控的主要下游靶点
不同于CRISPR，创新基因靶向平台达成1.47亿美元合作
原创 药明康德 药明康德 2022-07-06 07:31 发表于美国
EditForce近日宣布与田边三菱制药（Mitsubishi Tanabe Pharma Corporation）达成许可协议，使用EditForce的专利三角状五肽重复（Pentatricopeptide repeat，PPR）蛋白平台科技，共同针对中枢神经系统（CNS）领域内的特定靶标疾病进行潜在基因疗法的研究、开发与商业化。
PPR是一种最初在植物中发现，可以借由与DNA和RNA特定序列结合来调节基因表达的蛋白。一个PPR蛋白由一系列2-30个PPR模体（motif）所构成，每个模体含35个氨基酸，形成螺旋-环-螺旋结构。PPR蛋白具有许多功能，包含具有RNA重塑能力（RNA remodeling ability，可解开RNA二级结构）、保护RNA免于剪切和降解、执行RNA特定位置的剪切与碱基替换。PPR蛋白也在人类与酵母菌内被发现拥有类似功能。
这类PPR蛋白在基因疗法的开发上具有一定潜力。先前的研究发现，一个PPR模体能够识别一个碱基，且识别的特异性取决于该模体上三个位置的氨基酸序列。如果将20个PPR模体连接成一个PPR蛋白，就可以与特定的20个碱基序列结合。此PPR蛋白可以对此序列进行编辑，或借由将PPR蛋白与其他基因调控相关的蛋白质融合，调控那些造成疾病的RNA分子或基因表达通路，进而达成基因治疗的目的。
▲PPR蛋白的功能示意图（图片来源：EditForce公司官网）
与传统的锌指蛋白、TALEN、以及CRISPR基因编辑技术不同，PPR蛋白技术能通过蛋白质来靶向RNA分子。其官网也指出，这是唯一一个能以高度的设计灵活性来靶向RNA分子的蛋白平台。
▲PPR蛋白技术平台与常见平台的异同（图片来源：EditForce公司官网）
根据此协议，EditForce会根据药物开发和商业化阶段，以及药物全球销售的专利权使用费，自田边三菱制药获得预付款与阶段性付款总额达200亿日元（约1.46亿美元）的资金。EditForce将会使用这些资金进行其PPR蛋白平台科技的药物研发。
“田边三菱制药对我们的专利PPR蛋白平台科技有兴趣，而我很高兴我们可以与其达成协议，”EditForce的总裁兼首席执行官Takashi Ono博士说道，“我们期待可以通过与田边三菱制药密切的合作，使用我们的科技开发并递送突破性的药物产品给予那些受疾病所苦的病患。”
主题测试文章，只做测试使用。发布者：氨基酸肥料，转转请注明出处：https://www.028aohe.com/28609.html
