准备贮藏的大蒜应在叶片开始变黄时选晴天适时采收。收获时，先将大蒜下面的土壤刨松，以便植株易从土中拔出。收获后，将大蒜堆成堆，以蒜叶覆盖蒜头晒2–3天，待蒜秸开始萎蔫时，修剪根瓣，剪去叶茎，然后将蒜头放入筐内。最好将蒜头暴晒或人工干燥。人工干燥以30℃的温度，50％左右的空气相对湿度为宜，这有利于加速蒜头干燥，促进休眠，延长贮藏期。
1、低温贮藏：贮藏前应将蒜头晾干，如果未晾干，蒜头会因湿度过高而导致腐烂。大蒜一般应贮藏在温度0．6–0℃，空气相对湿度65％–70％，通风、干燥、无烟火的菜窖或房子里。此法可贮藏6–7个月。
2、高温贮藏：大蒜经历一个低温休眠阶段后，在5–18℃下会迅速发芽。将采收后的大蒜一直放在30–34℃高温环境中贮藏，可保鲜一年以上。此外，在相对湿度40％–50％的条件下，也可抑制蒜头的呼吸代谢，延迟发芽。低氧和高二氧化碳同样可抑制蒜头的呼吸和发芽。
留种大蒜宜采取高温贮藏，以温度为15℃左右、相对湿度不超过70％的条件为宜，这样有利于提高种性。如果冬季能确保温度稳定在-1–3℃，在播前40天左右改为18–20℃高温处理，也能收到同样的保鲜效果。
3、串挂贮藏：采收时将大蒜植株连根拔起，剔除过大、过小、腐烂或机械损伤和雨淋受潮的蒜头，再用刀沿鳞茎底盘将根须及夹带的一部分茎盘削去，只留下10–15cm假茎，注意削平茎盘。经暴晒或人工干燥后，将蒜头假茎用镀锌铁丝串起来，悬挂在房屋前后的屋檐下，或先将大蒜每8–10只扎成一把，再一排排串挂在屋檐下的铁丝或尼龙绳上自然风干。夏秋季可悬挂在临时凉棚、冷凉室内或通风贮藏库内；冬季最好移入通风贮藏库内，避免受潮受冻。
4、砻糠埋藏：在箱、筐或埋藏坑的底部先铺一层厚约2cm的砻糠，然后一层蒜头(2–3只蒜头高)一层砻糠，层层堆积至离容器口5cm左右，用砻糠覆盖，使蒜头不暴露在空气中。
5、化学贮藏：在大蒜收获前7天内，用0．1％–0．15％浓度的青鲜素(MH)水溶液喷洒。药液一定要喷均匀，叶片上下须布满雾珠。药后24小时内如遇雨，天晴后须重喷一次，一般喷药后可存放到新蒜上市。蒜头可悬挂、码堆在通风阴凉的地方保存。留种大蒜不能喷洒青鲜素。
6、涂膜保鲜：先将石蜡熔成石蜡液，然后将晒干的蒜头在石蜡液中浸一下即可。石蜡液温度不宜太高，浸的时间不宜太长，只要浸匀、浸透即可。此法可将蒜头贮存到翌年5月。
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