菜根肥料的施用方法主要包括以下几种：
有机肥施肥
有机肥包括堆肥、腐熟的动物粪便等，一般在菜根壮大前进行施肥。
将有机肥均匀地抹在菜园土壤表面，随后用铁耙将劈开的土壤翻过来混合，或者在土壤表面镶上厚厚的有机物厚度，这些都有助于土壤质量的提升和植株生长的促进。
化学肥料施肥
选择适量的化肥，根据菜园土壤导电性、PH值等因素进行添加，可以显著提高产量。
氮肥主要应用于托叶、应孕上方；磷肥则多用于伸长根、抽生菜等处；钾肥常常应用于叶茂松软处。常见的化肥包括复合肥、尿素、磷酸二铵等。
追浇肥施肥
在植物周期的关键时刻，如繁殖期、开花期、结果期等，将稀释后的肥料融入到水中，静置一会儿让肥料均匀分布，再浇灌到植物根部，以达到减少浪费，提高效益的目的。
深埋追肥
在蔬菜旁挖一条浅沟，将肥料埋入，盖上土，浇些水。要注意的是，沟不要离菜太近（距离菜根至少10cm）。这样追肥由于肥料集中，浓度大，不适应在夏季需水量大的季节使用。一般在冬闲季节，作物生长量不大时采用此法，让埋施的肥料逐步分解，不断供给作物。
冲水追肥
作物浇水时，把定量可溶于水的肥料撒在水壶内溶化，随浇水渗入作物根系周围的土壤内。这种方法浪费的肥料较多，且容易渗漏流失，肥力难达根部。在大面积蔬菜出现严重缺肥症状时，可以作为首选追肥方法。
叶面喷施
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