氨基酸实验室
四种DNA字母要编码20种氨基酸。绝不可能是一对一编码,也不可能是二对一编码,因为两个字母最多只能组成16种组合(4×4)。因此,最低要求是三个字母,也就是DNA序列里面最少要有三个字母对应到一个氨基酸,被称为三联密码,后来被克里克和西德尼·布伦纳证实。
但是这样看起来似乎很浪费,因为用四种字母组成三联密码,总共可以有64种组合(4×4×4),这样应该可以编码64个不同的氨基酸,那为什么只有20种氨基酸呢?一定有一个神奇的答案来解释为什么4种字母,3个一组,拼成64个单词,然后编码20种氨基酸。
1952年,沃森就曾写信告诉克里克:“DNA合成信使RNA(mRNA), mRNA合成蛋白质。”克里克开始研究这一小段mRNA的字母序列,如何翻译成蛋白质里面的氨基酸序列。他认为mRNA可能需要一系列“适配器”来帮助完成翻译,每一个适配器都负责携带一个氨基酸。当然每一个适配器一定也是RNA,而且都带有一段“反密码子”序列,这样才能和mRNA序列上的密码子配对。
适配器分子也由RNA分子组成。它们现在叫作“转运RNA”或tRNA。现在整个工程变得有点像乐高积木,一块块积木接上来又掉下去,一切顺利的话,它们就会这样一个接一个地搭成精彩万分的聚合物。
随着实验技术进步而且越来越精密,在20世纪60年代中期许多实验室陆续解开了序列密码。然而经过一连串不懈的译码工作后,大自然却好像随兴地给了个潦草结尾,让人既困惑又扫兴。遗传密码子的安排一点也不具创意,只不过“简并”了(意思就是说,冗余)。有三种氨基酸可对应六组密码子,其他的则各对应一到两组密码子。每组密码子都有意义,还有三组的意思是“在此停止”,剩下的每一组都对应一个氨基酸。这看起来既没规则也不美,根本就是“美是科学真理的指南”这句话的最佳反证。甚至,我们也找不出任何结构上的原因来解释密码排列,不同的氨基酸与其对应的密码之间似乎并没有任何物理或化学的关联。
克里克称这套让人失望的密码系统为“冻结的偶然”,而大部分人也只能点头同意。他说这个结果是冻结的,因为任何解冻(试图去改变密码对应的氨基酸)都会造成严重的后果。一个点突变也许只会改变几个氨基酸,而改变密码系统本身却会从上到下造成天大灾难。就好似前者只是一本书里无心的笔误,并不会改变整本书的意义,然而后者却将全部的字母转换成毫无意义的乱码。克里克说,密码一旦被刻印在石板上,任何想改动它的企图都会被处以死刑。这个观点至今仍有许多生物学家认同。
实验室如何节约用水
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- 在实验室,我们常会遇到一些用水问题,例如,实验室用水种类有哪些?如何根据不同的实验进行选择?又如何获得符合实验要求的用水?接下来,就与小析姐一起聊一聊上述的问题吧。
实验室常见用水的种类
1、蒸馏水(Distilled Water )
实验室最常用的一种纯水,虽设备便宜,但极其耗能和费水且速度慢,应用会逐渐减少。蒸馏水能去除自来水内大部分的污染物,但挥发性的杂质无法去除,如二氧化碳、氨、二氧化硅以及一些有机物。新鲜的蒸馏水是无菌的,但储存后细菌易繁殖;此外,储存的容器也很讲究,若是非惰性的物质,离子和容器的塑形物质会析出造成二次污染。
2、去离子水(Deionized Water )
应用离子交换树脂去除水中的阴离子和阳离子,但水中仍然存在可溶性的有机物,可以污染离子交换柱从而降低其功效,去离子水存放后也容易引起细菌的繁殖。
3、反渗水(Reverse osmosis Water)
其生成的原理是水分子在压力的作用下,通过反渗透膜成为纯水,水中的杂质被反渗透膜截留排出。反渗水克服了蒸馏水和去离子水的许多缺点,利用反渗透技术可以有效的去除水中的溶解盐、胶体,细菌、病毒、细菌内毒素和大部分有机物等杂质,但不同厂家生产的反渗透膜对反渗水的质量影响很大。
4、超纯水(Ultra-pure grade water)
其标准是水电阻率为18.2MΩ-cm。但超纯水在TOC、细菌、内毒素等指标方面并不相同,要根据实验的要求来确定,如细胞培养则对细菌和内毒素有要求,而HPLC则要求TOC低。
实验室用水等级划分
根据GB/T 6682-2008《分析实验室用水规格和试验方法》的规定,分析实验室用水的原水应为饮用水或适当纯度的水。并将实验室用水分为三个级别:一级水、二级水和三级水。
一级水用于有严格要求的分析实验,包括对颗粒有要求的实验,如高效液相色谱用水。一级水可用二级水经过石英设备蒸馏水或离子交换混合窗处理后,再0.2纳米微孔滤膜过滤来制取。
二级水用于无机痕量分析等实验,如原子吸收光谱人系用水。二级水可用多次蒸馏或离子交换等制取。三级水用于一般的化学分析试验。
三级水可用蒸馏或离子交换的方法制取。
表1 评价水质等级的技术指标如下:
根据实验要求选择相应的用水
1、生命科学用水
主要方向:DNA&RNA提取纯化/PCR/DNA测序;蛋白纯化/氨基酸分析/生物大分子分析;细胞培养/流式细胞分析;高通量筛选与扫描等精密生命科学仪器。
对水质要求如下:
2、色谱质谱用水
主要方向:液相色谱/超高效液相色谱/气相色谱;色谱质谱联用/串联质谱(LC-MS/MS)/ICP-MS ;制备/半制备液相色谱/层析色谱/凝胶色谱;总有机碳分析仪等精密有机分析仪器。
水质要求如下:
3、理化分析用水
主要方向:离子色谱/原子吸收光谱/原子荧光光谱 ICP-OES(AES) 颗粒计数等精密理化分析仪器。
水质要求如下:
现在知道该如何选择实验室用水了吗?
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如何正确地选择实验室用水?,实验室如何节约用水
突变氨基酸残基数是德尔塔的2.4倍!!Omicron刺突蛋白图像公布!
当地时间11月27日,来自意大利罗马耶稣儿童医院的多模式医学实验室公布了全球首张关于新冠病毒变异毒株Omicron(奥密克戎)的图片。
变化最大的已经用红色标识,密密麻麻的红色看得人直接头大,在德尔塔变异毒株中,突变的氨基酸残基数量为18个,而在新毒株奥密克戎中则有43个,更让人担心的是这些变异大部分位于与人体细胞相互作用的区域。
美国免疫学博士、哈佛医学院博士后王宇歌称“其RBD具有15个突变,是RBD突变最多的突变株,可能会影响抗体识别和疫苗接种”,这可能是最令人担心的!尽管Omicron变种要完全免疫逃逸不太可能,但可能会降低疫苗的效果,不过这个问题确认仍然需要时日。
Omicron变种时间线:
11月11日在非洲国家博茨瓦纳发现新冠变异新毒株B.1.1.529;
11月13日,被WHO列为了Variants of Concern(VOC,需要关注的变种),和肆虐印度席卷全球的Delta同一级别!
11月24日,南非豪登省检测到了突变毒株B.1.1.529;
11月26日,WHO将其命名为Omicron!
11月27日,荷兰已经检出61例;
另外:中国香港报告了2例Omicron,其中 1 人是来自南非的旅行者。11月26日,以色列也报告了1例确诊的Omicron和2例疑似病例。
新变种来袭,希望各位警惕并做好防护措施
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